ABINIT

ABINIT的主程序使用赝势和平面波。用密度泛函理论计算总能量、电荷密度、分子和周期性固体的电子结构；根据密度泛函计算的力与压强进行几何优化、分子动力学模；或根据密度泛函微扰理论生成动力学矩阵、波恩有效电荷、介电张量，以及其他的性质，以及许多其他的性质。激发态可以用含时密度泛函理论（对分子）或GW近似（多体微扰理论）计算。此外还提供了大量的工具程序。程序的基组库包括了元素周期表1-109号所有元素。 ABINIT适于固体物理，材料科学，化学和材料工程的研究，包括固体，分子，材料的表面，以及界面，如导体、半导体、绝缘体和金属。

一、脚本模板

#!/bin/bash #SBATCH –nodes=1 # 节点数量
#SBATCH --ntasks-per-node=56 # 每个节点核心数量
#SBATCH --ntasks=56 # 总核心数
#SBATCH --partition=g1_share # 队列分区且必须指定正确分区
#SBATCH --job-name=vasp # 作业名称
#SBATCH --output=vasp.%j.out # 正常日志输出 (%j参数值为 jobId)
#SBATCH --error=vasp.%j.err # 错误日志输出 (%j 参数值为jobId)

##############################################
# Software Envrironment #
##############################################
unset I_MPI_PMI_LIBRARY #取消默认mpi库，使用intel自带
export I_MPI_JOB_RESPECT_PROCESS_PLACEMENT=0 # intel 多节点作业所需修改参数
module load intel/2022 intelmpi/2022 # intel 环境加载

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# Run job #
##############################################
export OMP_NUM_THREADS=1
abinit < tstring.files >log ```

二、编译

  1. 环境加载

    module load intel/2022 intelmpi/2022

  2. 解压并进入软件目录

    tar zxvf abinit-8.10.3.tar.gz && cd abinit-8.10.3 && mkdir build tarballs

# 将LibXC 3.0.0，NetCDF 4.1.1和LAPACK for Abinit ≥ 6.10拷贝到tarballs中。

# 进入build文件夹中
# 在build中建立hostname.ac文件，内容如下：
    # ================================================================
# Configuration file for ABINIT 8 compilation on COBALT
# tested for Intel2015 + impi
#
# ================================================================
#
FC="mpiifort"
CC="mpiicc"
CXX="mpicxx"
#
enable_mpi="yes"
enable_openmp="yes"
#
with_linalg_flavor="mkl+scalapack"
with_linalg_libs=${SCALAPACK_LDFLAGS}
#
with_fft_flavor="fftw3"
with_fft_incs="-I${MKL_INCDIR}"
with_fft_libs=${MKL_LDFLAGS}
#
with_trio_flavor="netcdf"
with_dft_flavor="libxc"
    #在build中执行configure如下：
../configure --with-tardir=~/software/abinit-8.10.3/tarball

make mj56